Nikita (Peta Wilson) er dømt for et mord hun ikke har begått. Ufrivillig rekrutteres hun til en hemmelig statsorganisasjon, kjent som Section One. Under kodenavnet Josephine er hun klar til å bekjempe terrorister over hele verden - koste hva det koste vil. Hun lever på organisasjonens nåde, og følger hun ikke spillereglene, er det over og ut. Serien er basert på Luc Bessons film ved samme navn.