Den lille byen Eureka skjuler en mystisk hemmelighet. I mange år har den amerikanske regjeringen flyttet verdens smarteste mennesker til denne byen, hvor nyskapning og kaos råder side om side. Byen vises ikke på kartet og er ukjent for allmennheten. U.S. Marshal Jack Carter havner i Eureka etter å ha kjørt seg vill, og blir snart utpekt til sheriff i byen. Men livet i den hemmelige byen er langt fra problemfritt. Her kan alt skje, og det gjør det også.